Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21900J3QP38 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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