Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim18J3QNP2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms