Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm8005F6YKY3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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