Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syde2E9PUP1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms