Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5478D3Z6R0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms