Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cttnbp2B9EJA2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms