Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms