Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms