Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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PtprfA2A8L5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprfA2A8L5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PtprfA2A8L5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprfA2A8L5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprfA2A8L5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprfA2A8L5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprfA2A8L5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PtprfA2A8L5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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