Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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