Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn8Q9Z260 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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