Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms