Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Col4a3Q9QZS0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Col4a3Q9QZS0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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