Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nphp1Q9QY53 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nphp1Q9QY53 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms