Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim44Q9QXA7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trim44Q9QXA7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trim44Q9QXA7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trim44Q9QXA7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim44Q9QXA7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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