Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Csnk1eQ9JMK2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms