Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Chrac1Q9JKP8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Chrac1Q9JKP8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms