Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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