Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc28a3Q9ERH8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms