Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syvn1Q9DBY1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms