Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc89Q9DA73 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc89Q9DA73 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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