Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn22Q9D7U6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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