Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms