Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc7Q9D541 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccdc7Q9D541 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc7Q9D541 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc7Q9D541 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc7Q9D541 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccdc7Q9D541 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc7Q9D541 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc7Q9D541 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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