Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc83Q9D4V3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc83Q9D4V3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms