Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rfc5Q9D0F6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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