Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms