Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snf8Q9CZ28 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snf8Q9CZ28 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms