Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc5Q9CQA1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc5Q9CQA1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc5Q9CQA1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc5Q9CQA1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trappc5Q9CQA1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms