Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Prpf8Q99PV0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms