Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim3Q99PE5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms