Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrrtQ99MR6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrrtQ99MR6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms