Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp1b4Q99ME6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms