Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PtprtQ99M80 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PtprtQ99M80 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PtprtQ99M80 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprtQ99M80 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms