Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp5lQ99LH9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp5lQ99LH9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms