Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SmagpQ99KC7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms