Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Apobec3Q99J72 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Apobec3Q99J72 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apobec3Q99J72 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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