Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf112Q96DY5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf112Q96DY5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf112Q96DY5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf112Q96DY5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf112Q96DY5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf112Q96DY5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rnf112Q96DY5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf112Q96DY5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms