Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfdQ925I7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms