Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtpbp3Q923K4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms