Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Snx18Q91ZR2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Snx18Q91ZR2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms