Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc6a20aQ8VDB9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a20aQ8VDB9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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