Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc8Q8VD72 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ttc8Q8VD72 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms