Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh10Q8VCH7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh10Q8VCH7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms