Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Prpf39Q8K2Z2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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