Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mtmr3Q8K296 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mtmr3Q8K296 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mtmr3Q8K296 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Mtmr3Q8K296 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtmr3Q8K296 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Mtmr3Q8K296 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mtmr3Q8K296 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mtmr3Q8K296 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mtmr3Q8K296 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms