Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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