Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc17Q8CE13 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc17Q8CE13 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc17Q8CE13 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc17Q8CE13 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc17Q8CE13 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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