Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nhlrc3Q8CCH2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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