Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdac7Q8C2B3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms